Два зала новой экспозиции рассказывают о создании и деятельности советских органов государственной безопасности с октября 1917 г. по март 1953 г. 

В новой экспозиции посетители смогут увидеть дверь камеры Дома предварительного заключения; пулю, выпущенную при покушении на В. Володарского; значок № 1 Петроградского отделения спортивного общества «Динамо», принадлежавший Ф. Э. Дзержинскому; личные вещи главы ленинградских чекистов в 1920-е гг. С. А. Мессинга, руководителя контрразведки и разведки А. Х. Артузова, легендарных советских разведчиков Д. А. Быстролетова, В. А. Лягина, А. С. Феклисова и другие материалы из семейных архивов; видеохронику, связанную с историей отечественных органов государственной безопасности. Многие из представленных экспонатов демонстрируются впервые. 

Нормативные документы, фотографии, статистические данные раскроют участие чекистов в репрессивной политике Советского государства в период Гражданской войны (Красный террор), в годы НЭПа, индустриализации и коллективизации («Философские пароходы», «Шахтинское дело», дело «Весна» и др.), Большого террора (1937 – 1938 гг.) 

Экскурсия посвящена истории одной из сильнейших разведок мира, легендам и мифам внешней разведки СССР. На примере судеб знаменитых советских разведчиков - Р. Абеля (В. Фишера), К. Молодого и др. - раскрывается противостояние внешних разведок в период Холодной войны. Экскурсия освещает деятельность спецслужб, обеспечивавших политическую безопасность СССР, борьбу государства с инакомыслием, место и роль секретных спецслужб в политической системе общества. 

            Рассказ о судьбах руководителей дает возможность осветить деятельность КГБ и рассказать о человеке в системе органов госбезопасности. На экспозиции представлены портреты руководителей КГБ СССР, многочисленные фотографии, документы, личные вещи, книги с автографами. 

        Основной целью экскурсии является раскрытие главных направлений деятельности органов госбезопасности: борьба со шпионажем, терроризмом, инакомыслием, экономическими преступлениями. В основе тематической выставки - архивные документы из собраний Музея политической истории России, Государственного архива РФ, Архива Управлении ФСБ по Санкт-Петербургу и Ленинградской области и личных архивов сотрудников КГБ СССР. 

        Воссоздан исторический интерьер кабинета Ф.Э. Дзержинского, работавшего здесь в 1917-1918 гг. 

Сейчас кабинет является ярким эмоциональным центром экспозиции. Силами музейных сотрудников и петербургских реставраторов воссоздан исторический интерьер, восстановлены штофные обои, люстры, мебельный гарнитур работы рубежа XIX-XX вв.